供稿人:周思倩
适逢岳麓书院建立1040周年,365英国官网登录入口成立90周年大庆之际,应365英国上市公司在线邀请,清华大学张学工教授于2016年12月20日下午2点30在我校365英国上市公司在线负一楼报告厅作了题为“宏基因组数据的机器学习分析及SMRT测序进行DNA甲基化定量解析”的学术报告。来自我校365英国上市公司在线、信息科学与工程学院相关专业老师和研究生及部分校外老师学生参加了本次学术报告会。
他在报告中介绍了他们课题组近期的研究工作及成果,他们尝试用不基于比对的序列构成分析对微生物群落进行分析,采用组数据机器学习分析方法分析微生物群落之间的聚类关系、微生物序列构成与宿主表型之间的联系,同时还介绍了在用SMRT第三代测序数据定量解析微生物DNA甲基化修饰方面的新方法及其应用。张教授强调:对宏基因组测序数据,不论是以物种构成为重点的分析,还是以基因和通路为重点的分析,都需要与已知的参考基因组或功能注释数据库进行比对,不但计算量大,而且全部微生物中只有一少部分有较好的注释,很多信息无法利用。因此,借助计算机科学及数学方法来解读数据显得尤为重要。他还表示,机器学习分析和模式识别属于人工智能中的热点问题,大数据分析研究将成为新时代生命科学领域发展中难以阻挡的大趋势。
张教授于1994获清华大学模式识别与智能系统专业博士学位,是国家杰出青年基金获得者、国家973计划首席科学家,现为清华大学生命学院教授,清华信息国家实验室生物信息学研究部主任,清华大学学术委员会委员,兼任清华大学数据科学研究院医疗健康大数据研究中心副主任、清华大学合成与系统生物学研究中心执行主任,中国人工智能学会生物信息学与人工生命专业委员会主任、中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会常务副主任。在模式识别与机器学习、健康医疗大数据分析、RNA测序数据分析宏基因组测序数据分析等研究方向颇有建树。
通过此次学术报告,大家对宏基因组数据机器学习分析有了更为具体的认识,领悟到在现代科学研究中学科之间的交叉应用的必要性和重要性。报告会上,现场师生踊跃提问,就感兴趣的问题与张教授进行了热烈的讨论和交流。